Lincoln,
boa noite,
após a aplicação das notas da NT 003/2015 o standard alterou o comportamento com relação às estruturas disponibilizadas na BADI CL_NFE_PRINT, antes as informações eram enviadas à BADI e quando retornavam da BADI para o standard, as informações que se encontravam prontas, se não alteradas na BADI eram utilizadas como estavam, mas agora se voce não popular algumas informações, elas retornam em branco da BADI e estão sendo movidas em branco para envio ao GRC.
Portanto para solução do seu problema vá até a BADI CL_NFE_PRINT, que voce já deve ter implementada no seu ambiente, e ao final do código abap implementado acrescente uma linha movendo o o conteúdo de ID_DEST da estrutura IN_DOC para a OUT_HEADER, tal como:
OUT_HEADER-ID_DEST = IN_DOC-ID_DEST.
Se tiver o mesmo problema com alguma outra informação proceda da mesma forma.
Att,
Roney.